制備液相的目的是對產品的單體進行提取和純化。與傳統的純化方法（如蒸餾、萃取）比較，它是一種更有效的分離方法，因此被廣泛應用在樣品和產品的提取和純化上。隨著合成、植化、生化和制藥等領域對高純度組份的需求不斷增加，制備型液相色譜儀應用的領域也在迅速的擴大發展。
制備液相色譜儀的使用步驟
一、開機
1、接通電腦和儀器電源(接通電源之前可先把吸頭拿到要使用的流動相瓶中)；
2、開儀器電源開關，一般先上后下，下為檢測器開關；
3、檢查流動相是否夠，儀器上記錄的溶劑量時候正確；
4、開電腦；
5、打開儀器聯機軟件進入界面，點擊啟動設置泵流速為10，此時儀器中應該有液體流出；
6、點擊平衡然后點擊每個波長和調整；
沖一段時間，待壓力穩定后可以進樣。
二、進樣
1、將進樣器扭到load朝上，吸取一定量待分離液，
快速注入，做過的是吸取0.2毫升；
2、點擊控制界面菜單欄中“運行控制”按鈕—樣品信息—設置信息存儲路徑(每次都要做)；
3、扭動進樣器，使處于inload狀態，保留時間開始計時；
4、接峰；
5、所有峰出來后，點擊菜單欄中的中斷—中斷，準備重復進樣。
三、關機
1、點擊中斷后沖幾分鐘，將流速設為0，待壓力為0后將吸頭轉移到甲醇中，并把流速設為10；
2、沖到已經沒有東西被沖下為止，一般需要半個小時。一般此時壓力早已穩定；
3、將流速設為0，點擊界面上的關閉(在啟動旁邊)；
4、關閉窗口，彈出的窗口都點肯定的，如確定是等。
日常簡易保養及維護
1、流動相的抽濾要求：色譜純試劑，二次蒸餾水，緩沖鹽一定要過濾。
2、制備型液相色譜儀吸濾頭：特殊情況下可拆下濾頭抽取以判斷其中是否堵塞；亦可用注射器吸取流動相通過吸濾頭打出以判斷其是否堵塞。若有堵塞情況可用異丙醇超聲波清洗；清洗不成功則需要更換。
3、單向閥：如遇到泵壓不穩或流動相不能抽取，則可能是單向閥出現問題，卸下用異丙醇超聲波清洗，清洗時須按其安裝的反相放置在小燒杯中，切記不可與安裝方向倒置超洗！
4、泵頭：泵頭漏液或出現其它故障一般要申請維修（如漏液，或更換柱塞桿及其密封墊等）。
5、過濾片：當色譜峰出現異常情況時，有可能是此部件被污染，拆下用異丙醇超洗或更換制備型液相色譜儀過濾墊片
6、排液閥：此處不能*密封或漏液時一般是其中的墊片污染或磨損，可卸下后取出其墊片用異丙醇超聲波清洗或更換墊圈。
7、手動進樣器：平時應注意用二次蒸餾水和甲醇在裝載狀態及進樣分析狀態清洗；如出現漏液現象，原因極可能為轉子密封墊磨損或污染，一般須申請維修或更換制備型液相色譜儀配件。
8、制備型液相色譜儀流通池：在色譜峰不正常時可能是此部件被污染可拆卸后取出其中的墊片用異丙醇超洗（可根據說明書進行操作或申請維修）。
9、工作站：出現死機可重啟計算機；不正常運行時，首先可更換電腦測試其硬件故障；或在本機上重新插撥接口、重新安裝軟件。
進行分析時保留時間有時發生漂移，有時發生快速變化，有以下幾點原因：
1、溫度控制不好，解決方法是采用恒溫裝置，保持柱溫恒定。
2、流動相發生變化，解決辦法是防止流動相發生蒸發、反應等。
3、柱子未平衡好，需對柱子進行更長時間的平衡。
4、流速發生變化，解決辦法是重新設定流速，使之保持穩定。
5、泵中有氣泡，可通過排氣等操作將氣泡趕出。
6、流動相不合適，解決辦法為改換流動相或使流動相在控制室內進行適當混合。
制備液相色譜主要用于以下領域：
1.天然藥物化學、中藥化學。這是國內目前廣泛的使用方法，為了弄清楚植物中的微量有效成分，開放手工色譜柱早已不夠用了，幾乎每個搞天然藥化的實驗室都至少有一臺液相，土豪實驗室人手一臺液相。
2.蛋白純化。相對于前者，蛋白純化的起步要稍微晚一點，但是發展很迅速。同時，由于外國儀器廠家在這個領域的優勢不算太大，目前國內也在這個領域加快發展，搶占地盤。
3.藥物雜質純化。由于合成工藝并不能做到99%的產率，往往伴有副產品，如何獲得微量的雜質并確定結構和含量，這就得靠液相色譜。
4.手性化合物的制備。這個主要是有機合成和方法學的在用。
