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    純干貨!代謝流驗證哺乳動物胚胎發(fā)育的嘌呤合成途徑!

    閱讀:80      發(fā)布時間:2022-8-24
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    哺乳動物的胚胎發(fā)育過程復(fù)雜,其代謝物的調(diào)節(jié)及機制是動態(tài)且極其精細(xì)的。在妊娠中期時,隨著胚胎器官的發(fā)育,耗氧量和營養(yǎng)物質(zhì)的需求均顯著增加,代謝活動更為旺盛,而了解這些代謝過程對于胚胎發(fā)育的作用和影響至為重要。

    Nature在四月的正刊發(fā)表了美國德克薩斯州立大學(xué)西南醫(yī)學(xué)中心DeBerardinis教授課題組的研究[1],該研究使用代謝組學(xué)的方法以完整胚胎-胎盤為單位對于小鼠妊娠中期胚胎中的代謝進行了研究,揭示了妊娠中期胚胎和胎盤的代謝特征,并借助同位素標(biāo)記示蹤技術(shù),對其中的碳水化合物代謝途徑的差異和嘌呤的生物體內(nèi)快速合成進行了探索,為妊娠中期胚胎發(fā)育及胎盤營養(yǎng)的代謝機制研究提供了基礎(chǔ)。

    \  代謝途徑變化分析

    妊娠中期是胚胎發(fā)育、胎盤及代謝變化非常明顯的階段,在這段發(fā)育過程中,胚胎和胎盤重量快速增加,心臟、大腦和肝臟等器官迅速發(fā)育,并伴隨耗氧量的增加及代謝物的輪廓劇烈波動。

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    在小鼠的妊娠過程中,胎盤于妊娠3.5天形成,到9.5天時可同胚胎分離,其妊娠中期(GD10.5~13.5)的胎盤及胚胎重量、代謝物輪廓熱圖及代謝物種類均有明顯變化。由于胚胎和胎盤的細(xì)胞組成和功能差異很大,所以兩種組織的代謝輪廓在整個妊娠中期的差異也非常明顯,基于LC-Orbitrap MS的代謝組學(xué)的數(shù)據(jù)結(jié)果顯示在GD10.5到11.5之間的波動尤為明顯(見下圖),提示這段時間的代謝途徑變化非常劇烈。通過代謝通路富集分析及差異代謝物的對比,鎖定嘌呤和嘧啶代謝為胚胎中最重要的代謝變化,大部分嘌呤在GD10.5后持續(xù)增加,而嘧啶的量維持平穩(wěn),故針對嘌呤的體內(nèi)合成進行進一步研究。

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    \  嘌呤合成過程研究

    眾所周zhi,嘌呤在哺乳動物體內(nèi)的合成有兩種方式,從頭合成(de novo synthesis)[2]或補救合成(salvage synthesis)[3]

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    針對嘌呤的生物合成過程,使用穩(wěn)定同位素標(biāo)記的方法進行了研究。在GD10.5時將[13C]葡萄糖注入懷孕的小鼠,在保持血流供應(yīng)的情況下,并每隔30 min取其血、胚胎及對應(yīng)胎盤,對代謝物及其[13C]同位素標(biāo)記的特征峰進行動態(tài)監(jiān)測。

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    在灌注4小時后,嘌呤的同位素標(biāo)記比例達(dá)到穩(wěn)定狀態(tài),在胚胎中的同位素標(biāo)記程度高于胎盤,3種嘌呤(IMP、GMP和AMP)的穩(wěn)定同位素標(biāo)記比例及每個同位素標(biāo)記狀態(tài)由柱狀圖展示。同時發(fā)現(xiàn),R5P中同位素標(biāo)記的比例均低于3種嘌呤,且在嘌呤前體一碳單位氨基酸Ser和Gly中也發(fā)現(xiàn)明顯的同位素標(biāo)記情況,提示3種嘌呤在胚胎中的生物合成均采用從頭合成的方式。

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    \  結(jié)論驗證

    為驗證這個結(jié)論,作者在接下來的研究中進行了[13C]和[15N]的同時標(biāo)記,在給妊娠中期小鼠[13C]葡萄糖之外,添加注射[γ-15N]gu氨酰胺一小時,不出所料,果然在3種嘌呤中發(fā)現(xiàn)了[15N]的同位素標(biāo)記,從而嚴(yán)謹(jǐn)?shù)仳炞C了胚胎中的嘌呤是從頭合成的方式。

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    使用[13C]和[15N]雙穩(wěn)定同位素標(biāo)記進行代謝流的研究,對于分析儀器的分辨率要求非常高,該研究使用Q Exactive HF-X高分辨質(zhì)譜,在方法設(shè)置中使用12萬分辨率,得到穩(wěn)定可靠的數(shù)據(jù)。

    下圖為使用12萬分辨率設(shè)置采集的數(shù)據(jù)經(jīng)過Compound Discoverer軟件分析后得到的AMP的[M+H]+特征峰及其質(zhì)譜峰,在質(zhì)譜圖中,單同位素峰M+0使用淡紫色標(biāo)注,M+1同位素峰用綠色標(biāo)注,放大M+1同位素峰可看到AMP的[13C]和[15N]同位素峰被準(zhǔn)確標(biāo)注,可見其同位素峰分布的準(zhǔn)確度非常高。

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    看了這么多代謝流的研究,是不是對同位素標(biāo)記的數(shù)據(jù)很感興趣呢?掃描以下二維碼可進行Compound Discoverer軟件及代謝流示例數(shù)據(jù)的下載,高質(zhì)量軟件和數(shù)據(jù),一鍵試用!

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