原代細(xì)胞蛋白主要參與細(xì)胞的代謝過程

原代細(xì)胞分別描述基因的分子功能、參與的生物過程和所處的細(xì)胞位置。分子功能分析結(jié)果顯示：與PRRSV nsp11互作的宿主細(xì)胞蛋白具有結(jié)合能力和酶活性(圖 3A)；生物過程分析結(jié)果顯示：與nsp11互作的宿主細(xì)胞蛋白主要參與細(xì)胞的代謝過程，蛋白質(zhì)的轉(zhuǎn)錄、轉(zhuǎn)錄后修飾、翻譯、運(yùn)輸過程、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)，RNA的代謝過程等(圖 3B)；細(xì)胞位置分析結(jié)果顯示：與nsp11互作的宿主細(xì)胞蛋白主要分布于細(xì)胞質(zhì)、細(xì)胞膜、細(xì)胞核以及大分子復(fù)合體等部位。
KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)代謝通路注釋: KEGG是一個整合了基因組、化學(xué)和系統(tǒng)功能信息的數(shù)據(jù)庫。為了確定與PRRSV nsp11互作的宿主細(xì)胞蛋白所參與的主要生化過程和代謝通路，本研究利用KEGG數(shù)據(jù)庫對鑒定出的201個宿主細(xì)胞蛋白進(jìn)行pathway分類分析。結(jié)果顯示：與nsp11互作的宿主細(xì)胞蛋白主要參與核糖體代謝、碳代謝、剪切體代謝、氨基酸的生物合成以及病原的致病性等代謝通路。
原代細(xì)胞蛋白互作分析: 利用STRING在線分析軟件，對201個與PRRSV nsp11互作的宿主細(xì)胞蛋白進(jìn)行分析并繪制互作圖譜。根據(jù)分析結(jié)果，本研究從互作圖譜中選擇宿主細(xì)胞蛋白IRAK1對質(zhì)譜結(jié)果進(jìn)行驗(yàn)證。
對照品    含量測定    苯丁酸氮芥
對照品    含量測定    苯甲酸雌二醇
對照品    含量測定    丙酸睪酮
對照品    含量測定    醋酸氟輕松
對照品    鑒別    醋酸氯地孕酮
對照品    含量測定    醋酸潑尼松
對照品    含量測定    地塞米松磷酸鈉
對照品    含量測定    氨苯甲酸
對照品    檢查    對乙酰氨基酚
對照品    鑒別    泛影酸
對照品    HPLC法含量測定    格隆溴銨（曾用名：甘羅溴銨）
原代細(xì)胞