細胞轉錄組數據整合可推測ATCC細胞分化

ATCC細胞轉錄組測序技術作為強大的方法應用于分析發育和重編程過程的細胞異質性。分析細胞間異質性的關鍵目標就是尋找未知的細胞狀態或重構細胞譜系的發育軌跡。單細胞轉錄組數據中可能會包含一些生物或非生物的干擾因子（如細胞周期），現有的計算生物學分析方法往往需要先根據分析人員的判斷去除這些因子。

在很多情況下，細胞周期調控對發育和細胞分化起重要作用，比如G1和M期的長短調控神經細胞命運決定。研究表明，在小鼠胚胎發育中，神經發育是分步調控的過程。近年的研究闡明較多參與神經命運決定的分子和信號通路，然而，是否有其他因子以及這些因子如何相互作用調控神經命運決定尚未確定。

曾有研究表明，通過體外培養小鼠胚胎干細胞，神經細胞可以分步被誘導產生，并很好的模擬體內神經分化的過程。在該研究中，科研人員通過開發一種計算工具包（iCpSc）用于整合單細胞和群體細胞轉錄組數據，來預測細胞分化過程中單細胞的分化時間和路徑，通過在模擬數據集和文獻數據集中測試表明iCpSc的優勢。為進一步檢驗這一方法的有效性，研究人員采用研究小鼠神經分化的體外誘導模型，在非常密集的時間點中選取8個具有代表性的時間點，產生單細胞轉錄組和相應的群體細胞轉錄組數據，利用iCpSc預測每個單細胞的分化時間和路徑。之后，運用相關分析得到分化相關基因(“timer” genes)，并發現ATCC細胞周期調控因子富集在其中。通過構建基因調控網絡找到協調細胞周期和神經細胞分化的關鍵調控基因。Z后，通過對Fyn進行CRISPR/Cas9基因敲除實驗和小分子抑制劑實驗，驗證Fyn和M期在控制神經細胞分化時間中的作用。
Bismuth Subcarbonate (AS)    5892/10/4    1g    堿式碳酸鉍標準品
Boric Acid (AS)    10043-35-3    1g    硼酸標準品
Boswellia Serrata Extract        1g    乳香提取物標準品
Calcium Acetate (AS)    62-54-4    1g    醋酸鈣標準品
Calcium Carbonate (AS)    471-34-1    1g    碳酸鈣標準品
Calcium Chloride (AS)    10035-04-8    1g    氯化鈣標準品
Calcium Hydroxide (AS)    1305-62-0    1g    氫氧化鈣標準品
Calcium Lactate    63690-56-2    1g    乳酸鈣標準品
Calcium Levulinate (AS)    5743-49-7    1g    乙酰丙酸鈣標準品
Camphor    464-49-3    1g    樟腦標準品
Carisoprodol    78-44-4    1g    卡立普多標準品
ATCC細胞