分享大型癌細(xì)胞株治療信息數(shù)據(jù)庫

在發(fā)表的細(xì)胞株新研究論文中，Schreiber和Broad研究所的同事對這一門戶進行了描述，指出其中包含的信息是通過測量240種癌細(xì)胞系對于超過350種靶向細(xì)胞回路不同節(jié)點的化合物的反應(yīng)而獲得。這些細(xì)胞系來自許多不同種類的腫瘤，另一項稱作為癌細(xì)胞系百科全書（Cancer Cell Line Encyclopedia，CCLE）的互補研究已經(jīng)確定了這些細(xì)胞系的基因組特征。在美國國家癌癥研究所癌癥靶點發(fā)現(xiàn)和開發(fā)（CTD2）項目的支持下，CTRP充分利用了CCLE的公共數(shù)據(jù)，其中包含了有關(guān)每個癌細(xì)胞系突變、基因表達(dá)和其他基因組改變的信息。
Schreiber說：“CTRP和CCLE兩個項目顯著不同但又*地互補。兩者都是處于早期發(fā)展階段。隨著每個資源中數(shù)據(jù)的數(shù)量和多樣性不斷地增長，我們預(yù)計匹配患者與潛在有效藥物的能力將會大大地提高。”
Schreiber和同事們證明，研究中的這組化合物可以用來發(fā)現(xiàn)癌細(xì)胞系從前未檢測到的依賴性。隨著正常細(xì)胞一步步地變?yōu)榘┘?xì)胞，它會累積大量的促癌遺傳改變，使得細(xì)胞能夠不受控制地分裂和存活。此外，在癌癥形成的過程中，其他通常在細(xì)胞中發(fā)揮無害作用的基因有可能變得對癌癥生存至關(guān)重要。通過讓細(xì)胞系暴露于不同的化合物中，研究人員能夠揭示癌細(xì)胞生存所必需的蛋白質(zhì)，并有可能提供新的治療靶點。
Schreiber.說：“這些基因或許在癌癥早期階段沒有發(fā)揮內(nèi)在作用，但隨著癌細(xì)胞形成，它會收編一些正常的蛋白質(zhì)成為癌基因的伙伴。這就是我們真正想要揭露的：基因自身沒有被癌癥所改變，但卻與癌基因結(jié)合到了一起。這一門戶是揭示這些依賴性的一種好的途徑。”
在他們的論文中，Schreiber和同事們描述了一個如何利用CTRP來發(fā)現(xiàn)候選依賴性的例子。研究小組發(fā)現(xiàn)一種在細(xì)胞株肺癌臨床試驗中測試的藥物navitoclax，或許能夠尤其有效地靶向帶有CTNNB1突變的癌細(xì)胞系。CTNNB1突變存在于一些大腸癌、肝細(xì)胞癌、胃癌和子宮內(nèi)膜癌中。這只是一個關(guān)于CTRP如何能夠幫助揭示有用生物標(biāo)記物的例子，利用生物標(biāo)記物可以預(yù)測藥物反應(yīng)和耐藥。除了發(fā)現(xiàn)已開發(fā)藥物的新用途，CTRP還可用于鑒別新的治療靶點。
雷尼替丁相關(guān)物質(zhì)A標(biāo)準(zhǔn)品    91224-69-0     50mg    
雷尼替丁相關(guān)物質(zhì)B標(biāo)準(zhǔn)品    72126-78-4     50mg    
雷尼替丁相關(guān)物質(zhì)C標(biāo)準(zhǔn)品    73851-70-4     50mg    
類姜黃素標(biāo)準(zhǔn)品        300mg    Curcuminoids
利巴韋林標(biāo)準(zhǔn)品    36791-04-5     200mg    Ribavirin 
利多卡因標(biāo)準(zhǔn)品    137-58-6     250mg    Lidocaine 
利福布丁標(biāo)準(zhǔn)品    72559-06-9     50mg    Rifabutin
利福平標(biāo)準(zhǔn)品    13292-46-1     300mg    Rifampin 
利福平醌標(biāo)準(zhǔn)品    13983-13-6     25mg    Rifampin Quinone 
利魯唑標(biāo)準(zhǔn)品    1744-22-5     200mg    Riluzole 
利魯唑相關(guān)物質(zhì)A標(biāo)準(zhǔn)品    461-82-5     25mg    Riluzole Related Compound A
利奈孕醇標(biāo)準(zhǔn)品    52-76-6     20mg    Lynestrenol
利尿酸標(biāo)準(zhǔn)品    58-54-8    200mg    Ethacrynic Acid
細(xì)胞株