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在氣液色譜中，混合物的分離取決于組分在氣相色譜儀中的分壓和活度系數。前者與組分的沸點有關，后者與組分和固定液之間的作用力有關，而后者是氣相色譜與蒸餾分離的本質區別，也是氣相色譜法分離效率遠大于蒸餾法的原因。
組分與固定液分子間的相互作用直接影響色譜柱的分離情況。顯然，與固定液作用力大的組分將后流出；相反，作用力小的組分則先流出。因此，在色譜分析前，必須充分了解試樣中各組分的性質和各類固定液的性能，以選用zui合適的固定液。
分子間的作用力是一種極弱的吸引力，主要包括靜電力、誘導力、色散力和氫鍵力等。如在極性固定液柱上分離極性樣品時，分子間的作用力主要是靜電力，被分離組分的極性越大，與固定液間的相互作用力就越強，因而該組分在柱內的滯留時間久越長。
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