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    乳酸菌在白酒發(fā)酵過程中的功能與作用研究

    時間:2018-7-24閱讀:1746
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    IL-11elisa試劑盒
    1、 樣品的采集樣品為山東芝麻香型白酒酒醅。芝麻香型白酒釀造分為堆積發(fā)酵和窖池發(fā)酵兩個發(fā)酵階段,跟蹤采集了芝麻香型白酒釀造過程中堆積發(fā)酵和窖池發(fā)酵過程中的酒醅。選擇 I、II 兩個班組堆積酒醅作為平行樣品進行跟蹤取樣,不同取樣位置取 50 g 左右酒醅混合成一個樣品。堆積發(fā)酵周期為 18 h,每隔 6 h 取一次樣品,取樣時間分別為 0、6、12、 18 h。窖池發(fā)酵周期為 50 d,取樣時間分別為 3、5、 10、15、20、25、30、35、40、50 d。將采集的酒醅樣品密封,−80 °C 保存。
    2、 主要試劑和儀器磷酸二氫鈉、磷酸氫二鈉、10 mmol/L Tris-HCl (pH 8.0)、、10% SDS、乙酸鈉、、乙醇購自國藥集團化學(xué)試劑(北京)有限公司;溶液、2SG Fast qPCR Master Mix (High Rox)購自生工生物工程(上海)股份有限公司。冷凍離心機,Beckman Coulter 公司;MiniBeadbeater 細胞破碎儀,Biospec 公司;Genius 3 旋渦振蕩器,IKA 公司;真空干燥箱,上海一恒科技有限公司;NanoDrop 8000 蛋白核酸測定分光光度計、熒光定量 qPCR,Thermo Fisher Scientific 公司。
    3、 DNA 的提取、PCR 擴增及測序準確稱取 7 g 酒醅,加入 20 mL 無菌的 PBS 緩沖液(0.042 3 mol/L 磷酸二氫鈉,0.057 7 mol/L 磷酸氫二鈉)懸浮,漩渦振蕩,300×g 離心 5 min,收集上清液。將上清液 10 000×g 離心 15 min 收集細胞沉淀。DNA 的提取參考 Wang 等的方法。采用適用于大多數(shù)細菌的 16S rRNA 基因 V3−V4 區(qū)通用引物 338F (5′-ACTCCTACGGGAGGCAGCA-3′) 和 806R (5′-GGACTACHVGGGTWTCTAAT-3′)。 PCR 擴增體系(20 μL):5×FastPfu 緩沖液 4 μL, 2.5 mmol/L dNTPs 2 μL,5 μmol/L 上、下游引物各 0.8 μL,F(xiàn)astPfu 聚合酶 0.4 μL,樣品基因組模板 DNA 10 ng,超純水補足至 20 μL。PCR 反應(yīng)條件: 95 °C 3 min;95 °C 30 s,55 °C 30 s,72 °C 45 s,共 27 個循環(huán);72 °C 10 min。將 PCR 產(chǎn)物進行瓊脂糖凝膠電泳分析,對 DNA 條帶進行切膠純化回收。純化后的 PCR 產(chǎn)物進行定量,根據(jù)定量結(jié)果混合不同樣品的 PCR 產(chǎn)物。構(gòu)建 MiSeq 文庫,使用 Illumina MiSeq PE300 測序平臺測序。通過 QIIME (v1.8.0)和 Mothur 對測序結(jié)果分析處理,去掉質(zhì)量不好的序列、長度小于 150 bp 的序列及含嵌合體的序列,并將相似度大于 97%的序列聚類為一個操作分類單元 OTU (Operational taxonomic unit)。計算 Shannon 指數(shù)(反映樣品的多樣性程度) 和 Chao1 指數(shù)(反映樣品中群落豐富度),評估樣品微生物多樣性。利用在線比對引擎 BLAST 將 OTU 的代表序列在美國國家生物技術(shù)信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)上與 GenBank 數(shù)據(jù)庫中的序列進行比對,獲得 OTU 的物種信息。

     

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