超保守元件（UCE）探針
UCE 是序列高度保守的基因組區域，在其側翼有很多可變序列。因為許多基因組區域在大的分類范圍內共享，在新物種和非模式物種的研究方面，這些關鍵區域作為系統發育的理想目標捕獲候選區域已被定義和開發。 Arbor Biosciences 為各種分類學類群提供一系列即用型 UCE 探針，包括脊椎動物、昆蟲和植物中鑒定出的類似的保守直系同源基因位點。
超保守元件（UCE）探針
超保守元件（Ultra Conserved Elements, UCEs）是序列高度保守的基因組區域，在其側翼有很多可變序列。因為許多基 因組區域在大的分類范圍內共享，在新物種和非模式物種的研究方面，這些關鍵區域作為系統發育的理想目標捕獲候選 區域已被定義和開發。 Arbor Biosciences 為各種分類學類群提供一系列即用型 UCE 探針，包括脊椎動物、昆蟲和植物中 鑒定出的類似的保守直系同源基因（ Conserved Orthologous, COS ）位點。
產品特點
預設計 - 由專家設計，可立即使用
結果經驗證 - 被同行認可的論文不斷增多
流水線分析 - 簡單、方便的數據分析
性價比高 - 多個遠親類群使用一套探針集
完整的解決方案 - 試劑盒包括所有必要的試劑
應用范圍廣 - 具有適用性高的通用 Panels
產品應用
• 系統發生學
• 群體遺傳學
• 系統發生樹
• 側翼區捕獲
即用型 PANELS
脊椎動物 • 輻鰭魚類 0.5Kv1 • 鱸形目 1Kv1 • 骨鰾魚類 2.7Kv1 • 脊椎動物 2.5Kv1、5Kv1 和 5Kv2B
無脊椎動物 • 蛛形綱 1.1Kv1 • 蜘蛛目 2Kv1 • 鞘翅目 1.1Kv1 • 雙翅目 2.7Kv1 • 半翅目 2.7Kv1 • 膜翅目 1.5Kv1、2.5Kv2P、2.5Kv2A 和 2.5Kv2AB • 鱗翅目 1.3Kv1 • 新 panels 咨詢
產品列表
| 類別 | 產品名稱 | 產品詳情 |
| 輻鰭魚類 | myBaits UCE Actinopterygians 0.5Kv1 | 含2001個探針(120mer)，可以富集輻鰭魚類中的 500個 UCE 位點 |
| 鱸形目 | myBaits UCE Acanthomorph 1Kv1 | 含 2628個探針(120 mer)， 可以富集鱸形目中的 1314個UCE 位點 |
| 骨鰾魚類 | myBaits UCE Ostariophysan2.7Kv1 | 含 6737 個探針(120 mer)，可以富集骨鰾魚類中的 2708 個 UCE 位點 |
| 菊科 | myBaits COS Compositae 1Kv1 | 含 9678 個探針(120 mer)，可以富集菊科中的 1061 個直系同源基因，可以富集>700個位點 |
| 脊椎動物 | myBaits UCE Tetrapods 2.5Kv1 | 含2560個探針(120 mer)，可以富集脊椎動物中的 2386個UCE 位點，其中鳥類和爬行動物 2.2k，哺乳動物約1k |
| myBaits UCE Tetrapods 5Kv1 | 含5472 個探針(120mer) ，可以富集脊椎動物中的 5060個 UCE位點，其中鳥類和爬行動物 4k，哺乳動物約2-3k，兩棲動物1k | |
| mvBaits Tetrapods 5Kv2B | 該版本已經針對化石或者糞便樣本做過優化，探針的長度是80nt，與其他兩款的區別:與 5KV1 版本覆蓋物種基本相同，針對降解比較嚴重的樣本效果會更好 | |
| 蛛形綱 | mvBaits UCE Arachnida 1.1Kv1 | 含14799個探針(120mer)，可以富集蛛形綱(蜘蛛，螨蟲，蝎子，盲蜘蛛及其近親中的1120個 UCE 位點 |
| 蜘蛛目 | myBaits UCE Spider 2Kv1 | 含15015個探針(120mer)，可以富集蜘蛛目中>2000個UCE位點 |
| 鞘翅目 | myBaits UCE Coleoptera 1.1Kv1 | 含13674個探針(120mer)，可以富集鞘翅目中的 1172個 UCE 位點 |
| 雙翅目 | myBaits UCE Diptera 2.7Kv1 | 含31328 個探針(120mer)，可以富集雙翅目中的 2711個 UCE 位點 |
| 半翅目 | myBaits UCE Hemiptera 2.7Kv1 | 含 40207 個探針(120 mer)，可以富”集半翅目中的2731個UCE 位點 |
| 膜翅目 | myBaits UCE Hymenoptera 1.5Kv1 | 含2749 個探針(120 mer)，可以富集膜翅目(螞蟻、蜜蜂、葉蜂和黃蜂)中的1510個UCE位點 |
| myBaits UCE Hymenoptera 2.5Kv2P | HymV1的擴展版本，含 31829 個探針(120 mer)，可以富集膜翅目(螞蟻、蜜蜂、葉蜂和黃蜂)中的2590個UCE位點 | |
| myBaits UCE Hvmenoptera 2.5Kv2A | Hym2.5Kv2P的子集，僅含螞蟻基因組探針9898個(120 mer)，可以富集 2524 個UCE 位點和 16個核基因外顯子區域(外顯子根據四種遠緣螞蟻物種設計，共12個基因) | |
| myBaits UCE Hymenoptera 2.5Kv2AB | Hym2.5Kv2P的子集，僅含螞蟻和蜜蜂基因組探針 9332個(120 mer)，可以富集 2545 個UCE 位點和 12個核基因外顯子區域(7個基因) | |
| 鱗翅目 | myBaits Lepidoptera 1.3Kv1 | 含 14363 個探針(120 mer)，可以富集鱗翅目(蝴蝶、蛾類及其近緣物種)中1381個UCE位點 |
| 其他物種UCE可定制，詳情請聯系我們。現有定制案例：兩棲類、珊瑚等。 | ||
參考文獻
• B.C. Faircloth et al. (2015). Target enrichment of ultraconserved elements from arthropods provides a genomic perspective on relationships among Hymenoptera. Molecular Ecology Resources
• B.C. Faircloth et al. (2012). Ultraconserved Elements Anchor Thousands of Genetic Markers Spanning Multiple Evolutionary Timescales. Systematic Biology
• J.E. McCormack et al. (2016). Sequence capture of ultraconserved elements from bird museum specimens. Molecular Ecology Resources
• J. Starrett et al. (2017). High phylogenetic utility of an ultraconserved element probe set designed for Arachnida. Molecular Ecology Resources
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