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    HBV變異對乙肝病毒檢測的影響

    來源:上海百蕊生物科技有限公司   2010年11月30日 17:00  

    [摘 要] 目的:了解無錫地區(qū)HBV前C/C基因變異情況,探討基因變異對乙肝病毒標志物(HBVM)及HBV DNA定量的影響。方法: HBVM用時間分辨熒光定量試劑檢測;HBV DNA定量PCR以德國Roche Lightcycler 熒光定量擴增儀檢測;HBV DNA前C/C測序使用①德國Roche Mag NA Pure LC 全自動核酸提取,加樣系統(tǒng);②美國Beckman Coulter CEQ 8000 Genetic Analysis System。結果: 92例乙肝患者血清中有41例(446%)發(fā)生前C/C區(qū)nt1896位變異,41例中有34例HbeAg陰性,7例HbeAg仍為陽性;以nt1896位是否變異分組,變異組和未變異組HBV DNA定量無顯著性差異。結論: nt1896位變異導致HBeAg轉陰,HBV病毒變異對HBVM有決定性的影響,但該變異對HBV復制無影響。
        HBV感染在臨床可產(chǎn)生不同的肝臟疾病譜,過去多以HBV免疫學標志物來判斷病毒感染狀況[1]。但隨著分子生物學技術的發(fā)展,研究發(fā)現(xiàn)肝臟疾病譜不僅與宿主的免疫有關,也與病毒本身密切相關,即HBV 本身也存在變異。對HBV變異的判斷,zui可靠和的方法是從病人體內(nèi)檢出HBV DNA,用DNA測序法來確定病毒的變異,目前對于HBV的變異的研究比較集中在關于前C區(qū)及S基因區(qū)的變異。本文結合92例乙肝患者的PCR定量、免疫學標志物定量結果以及DNA前C/C區(qū)測序結果報道如下。
        1  材料與方法
        11  分析對象
        本組92例為無錫地區(qū)2004年1月~10月在無錫市傳染病醫(yī)院門診及住院的乙肝患者,均為HBVDNA陽性病人。
        12  檢測方法
        121  乙肝病毒標志HBsAg、抗HBs、HBeAg、抗Hbe和抗HBc以美國PE123utomatic immunoassay system 檢測,試劑為上海新波產(chǎn)的兩對半時間分辨熒光定量試劑。
        122  定量聚合酶聯(lián)反應(PCR)HBV DNA定量PCR  以德國Roche Lightcycler熒光定量擴增儀檢測,試劑為深圳匹基產(chǎn)HBV DNA熒光定量試劑。
        123  HBV DNA前C/C區(qū)測序 使用①德國Roche MagNA Pure LC全自動核酸提取、加樣系統(tǒng),獲得HBV DNA模板;②在美國PE9600擴增儀擴增:94℃預變性3 min,94℃ 30 s,50℃ 30 s,72℃ 30 s,循環(huán)35次;③用Promega公司的PCR產(chǎn)物純化試劑盒純化PCR產(chǎn)物;④純化產(chǎn)物用Beckman測序試劑盒進行測序反應:96℃ 20 s,55℃ 20 s,60℃4 min,循環(huán)30次,終止測序反應,然后在美國Beckman Coulter CEQ8000 Genetic Analysis System上得到HBV DNA 的序列和圖譜。所測HBV DNA序列的堿基位置:nt17372483,所測長度:746 bp,上游引物序列及位置:5’GAGTTGGGGGAGATTAG3’(17371756),下游引物序列及位置:5’AAAGTTTCCCACCTTATGAGTC3’(24832462);引物由上海生工生物工程技術有限公司合成。
        124  統(tǒng)計學處理 采用t檢驗和χ2檢驗。
        2  結 果
        略
        3  討 論
        表1中HBV DNA 1827位ntc→a突變達88%, 表2  HBVM與1896位變異表3  1896位變異與e抗原相關性表4  病毒與DNA定量相關性基本體現(xiàn)無錫地區(qū)HBV DNA單核苷酸多態(tài)性突變水平,意義目前不詳。1896位ntg→a突變達446%(41/92),據(jù)國外報道,這種變異大多發(fā)生在亞洲東部及南歐地區(qū),發(fā)生率可以高達47%~60%,而在美國只有10%左右,胡耀仁等[2]報道寧波乙肝患者1896位變異率為4258%,本文結果與報道相近。由于1896位ntc→a突變(*→腺嘌呤),使原來編碼*的前C區(qū)第28個密碼子(TGG)轉變?yōu)榉g終止密碼子(TAG),因而前C蛋白的翻譯中斷,HBeAg不能產(chǎn)生,檢測會出現(xiàn)陰性結果,從表3中可見,與變異有關HBeAg轉陰有34例,從而證實1896位變異與HBeAg轉陰具有密切相關性。2005位ntt→a突變和2074位ntt→c突變因為是密碼子的第三堿基發(fā)生突變,翻譯的氨基酸仍是原來的氨基酸,屬同義突變。
        圖譜分析是測序儀利用4種熒光染料分別標記終止物ddNTP,通過電泳將各個熒光標記片段分開,經(jīng)激光掃描,光柵分光,區(qū)分代表不同堿基信息的不同顏色的熒光,在 CCD攝影機上同步成像。圖1顯示1896位正常為G,圖2顯示1896位發(fā)生突變?yōu)锳。
        從表3可以看出(由表2中統(tǒng)計而來),1896位變異組共有41例,其中34例e抗原陰性,說明與1896位變異有密切關系(P<0005);有7例e抗原仍為陽性,可能與體內(nèi)仍存在野生株復制的情況有關。在51例1896位未變異一組,其中13例e抗原陰性,而HBV DNA定量顯示有病毒的復制,與理論結果不符,原因可能與其他位點變異有關。
        從表4中可以看出以nt1896位變異分組,兩組病毒DNA定量無顯著性差異(P>005),說明1896位變異會導致HBeAg不能產(chǎn)生,檢查陰性結果,但不能反映HBV復制減輕和消失,而仍有HBV前C區(qū)變異病毒的存在和復制,結論與文獻相符[3]。
        李伯安等[4]認為單獨的血清學標志檢測不能反映肝臟的病變程度,也不能良好反映病毒的復制。
        臨床上對不同肝臟疾病譜的認識,有必要結合二對半結果和PCR DNA定量以及基因測序結果,才會對乙肝病毒的感染狀況有一個比較準確的判斷,才能對癥治療,取得較好的治療效果。由于前C/C區(qū)1896位的變異,導致HBeAg轉陰,不能就此而否定病毒的復制。
        測序結果表明,HBV病毒基因變異對HBVM結果產(chǎn)生根本性的影響,它們是基因型和表現(xiàn)型的關系,即基因型決定表現(xiàn)型,但病毒復制繼續(xù)進行。


     

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