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乙酰輔酶A是輔酶A的乙酰化形式，可以看作是活化了的乙酸。 基團 (CH3CO- = 乙酰基)與輔酶A的半胱氨酸殘基的SH-基團相連。這其實是高能鍵硫酯鍵。它是脂肪酸的beta-氧化及糖酵解后產生的丙酮酸氧化脫羧的產物。在許多代謝過程中起著關鍵的作用。
乙酰輔酶A是能源物質代謝的重要中間代謝產物，在體內能源物質代謝中是一個樞紐性的物質。糖、脂肪、蛋白質三大營養物質通過乙酰輔酶A匯聚成一條共同的代謝通路——三羧酸循環和氧化磷酸化，經過這條通路*氧化二氧化碳和水，釋放能量用以ATP的合成。乙酰輔酶A是合成脂肪酸、酮體等能源物質的前體物質，也是合成膽固醇及其衍生物等生理活性物質的前體物質。
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