雖說隨著我們的不斷努力，水質監測工作已經取得了盡人意的成績，但這不代表就沒有問題的存在了。目前監測站網還沒有覆蓋所有地區，供水的企業是需要安裝標準要求來完成相應的水質檢測項目，由于多方面的因素，企業并沒有完成所有指標的檢測，那么為了有效的應對水質監測中存在的問題，需要從以下幾個方面做起！
一、建立有效長期的水資源監測管理體系
我國的環境監測是屬于同一個生態系統的流域是有多個部門管轄，這么一來就缺少對全流域范圍內的整體考慮。一旦出現突發水質污染事件，這樣就會涉及到水利、環保、交通、供水、城市建設和規劃等多個部門，如果不是同層級的不能就很難做到一致。由此可見，建立長期有效的水資源監測管理體系尤為重要，明確監測機構和人員的職能，各大部門的任務分工明確，同時需要相互協助配合，確保檢測數據的科學性與公信力，為開展水資源監督、評價、考核等提供好的條件。
二、開展水質預測研究
我國目前水質檢測問題主要是以水質監測和水污染控制為主，對水質預測的分析研究還沒有系統化。且自我國開展水質監測工作以來，累積了不少監測數據，監測成果并沒有都被系統化利用。所以針對我們水質的監測現狀及各種實驗結果來分析，我們可以主要開展水質，包括不同河域、不同季節影響水質的各種因素，有準備的進行水質在線監測和水利應用，從而來提高水資源的服務能力。
三、增強投入的力度，提升工作人員的綜合素質
我們知道水質監測行業是屬于技術密集型的行業，涉及到的技術領域有多個，比如：電子、軟件、機械等。這樣是需要有經驗累積才行的！還要以研發與技術人員推動行業的發展。這其實是目前該行業較為缺乏的，所以說增強投入力度，提升工作人員的綜合素質尤為重要！我們要通過加強技術引導，加大對關鍵技術的投放力度，同時重視科研人的培養，增強監測隊伍監測，提高監測人員的綜合素質去推動水質監測行業的健康可持續發展。
四、第三方監測機構
就目前我國只有個別城市嘗試數據監測方面引入第三方機構，很多地方還是會在當地環保部門內部安排相關部門進行監測工作，監測的質量各方面穩定性很難被公正監督，監測的過程如果存在問題也很麻煩。那么第三方機構監測的話，他可以保證檢測結果真實可靠性！不過，對于第三方監測機構也是要加強監管的，避免供水的企業和第三方機構成立利益共同體。
五、公開對水質監測的信息
水質監測的信息公開，無可厚非這是公眾的知情權、參與權和監督權。需要定期公布數據和分析結果，實現公眾與相關部門的信息互動。這樣有助于恢復民眾對水質的信心，從而提高大家對相關部門的信任，也有助于強化公眾參與和社會監督！
