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ATP熒光檢測儀可以檢測食品原料、加工食品、食品用具、包裝材料等的安全性，并判斷衛生情況。大腸菌群是判斷食品微生物污染的主要指標之一，大腸菌群超標的原因包括食品加工原料、包裝材料和食品生產中使用器具的微生物污染。菌落總數通常用來評價食品的潔凈度，所以ATP熒光檢測儀可以檢測食品中的菌落總數和大腸菌群，從而判斷食品的微生物污染情況。同時，ATP熒光檢測儀不僅可以檢測食品，還可以檢測食品加工原料、食品包裝材料、加工設備和環境衛生，避免食品被污染的可能。
一般來說，微生物不僅可以在食品加工中發揮有益的作用，也可以通過食品對人的健康構成威脅。食品的微生物檢測是食品檢測中*一部分，是衡量食品衛生質量的重要指標之一，也是判斷被檢食品是否安全可食用的科學依據之一。同時，微生物檢測可以判斷食品加工環境和食品衛生環境，正確評價食品被細菌污染的程度，為衛生管理提供科學依據。
ATP熒光檢測儀適用于快速檢測餐具和食品加工用具的表面清潔度，ATP是生物能轉化的產物，存在于所有活的細胞體中，當ATP與熒光素酶接觸時，會發生反應產生光，物體表面殘留的食物和微生物越多，ATP就越多，熒光就越強。使用ATP熒光檢測儀可以記錄這種光的強度，以判斷受檢樣品的衛生狀況。
