室內環境主要包括溫度濕度及二氧化碳的含量，放置紅外光譜儀的實驗室不宜過大，以更好的保證溫度的恒定，同時需要安裝除濕裝置并定期開機運行防止受潮。每次進入實驗室的人數不宜過多并需要定期通風換氣以保證二氧化碳的濃度不會太高。

與原子熒光光譜儀不同紅外光譜儀的常用試樣制備方法是壓片法，壓片過程是否嚴謹也影響著操作準確度并與儀器的使用壽命相關，正確使用壓片的關鍵包括樣品取用量研磨方式細致程度及是否鋪勻等，保證一系列操作都準確無誤后可以減少重復測試也就降低了儀器的損耗。

紅外光譜儀使用后的清潔顯然是保養中不容忽視的一個環節，特別是壓片用的模具在使用后應立即擦拭干凈，必要時需要用清水洗凈并置于干燥器皿中保存以防止腐蝕。值得注意的是如果測定用樣品不夠干燥，應在研細后置于紅外燈下烘幾分鐘使其干燥后再上機測試。