電磁流量計的調試期故障通常出現在它的初始安裝期間，但如果我們能很快的排除這些故障，電磁流量計依舊可以運轉自如。一般情況下，我們見到的調試期故障大部分是由于安裝不當、環境干擾和流體的特性影響等原因造成的。
1、安裝方面
通常是電磁流量計傳感器安裝位置不正確而引起的故障，常見的比如將傳感器安裝在易積聚氣體的管系較高點，或安裝在自上而下的垂直管上，可能出現排空或者傳感器后無背壓，流體直接排入大氣而形成測量管內非滿管。
2、流體方面
被測液體中含有均勻分布的微小氣泡通常不會影響到電磁流量計的正常工作，但是隨著氣泡的增大，儀表輸出的信號就會出現波動，如果氣泡大到足以遮蓋整個電極表面的時候，隨著氣泡流過電極會使電極回路瞬間斷路而使輸出信號出現更大的波動。
低頻方波勵磁的電磁流量計測量固體含量過多漿液時，也將產生漿液噪聲，使輸出信號產生波動。
3、環境方面
環境方面通常主要表現在管道雜散電流干擾、空間強電磁波干擾、大型電機磁場干擾等。管道雜散電流干擾通常采取良好的單獨接地保護就可獲得滿意結果，但如遇到強大的雜散電流(如電解車間管道，有時在兩電極上感應的交流電勢峰值Vpp可高達1V)，尚需采取另外措施和流量傳感器與管道絕緣等。
空間電磁波干擾一般經信號電纜引入，通常采用單層或多層屏蔽予以保護。
低頻方波勵磁的電磁流量計測量固體含量過多漿液時，也將產生漿液噪聲，使輸出信號產生波動。
測量混合介質時，如果在混合未均勻前就進入流量傳感進行測量，也將使輸出信號產生波動。
如果電極材料與被測介質選配不當的話，也將由于化學作用或極化現象而影響正常測量。應根據電磁流量計選用或有關手冊正確選配電極材料
